MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-5 DNA

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020823	A	6	6	887	892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020823	T	6	6	922	927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020823	ATT	2	6	933	938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020823	GTACA	2	10	944	953	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020823	GTACA	2	10	1007	1016	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020823	A	7	7	1080	1086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020823	CACC	2	8	1087	1094	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_020823	A	6	6	1117	1122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020823	CAT	2	6	1125	1130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020823	TAT	2	6	1142	1147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020823	CAA	2	6	1249	1254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020823	GTG	2	6	1273	1278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020823	GGT	2	6	1307	1312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020823	AACA	2	8	1356	1363	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020823	CTA	2	6	1384	1389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020823	T	6	6	1395	1400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020823	GTG	2	6	1435	1440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020823	CGAC	2	8	1482	1489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020823	TGA	2	6	1647	1652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020823	TCC	3	9	1988	1996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_020823	GTT	2	6	2028	2033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020823	GCC	2	6	2066	2071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_020823	A	6	6	2098	2103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020823	T	6	6	2129	2134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020823	CAA	2	6	2229	2234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020823	AGA	2	6	2629	2634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020823	GTA	2	6	2751	2756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020823	GTA	3	9	2762	2770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020823	AAAG	2	8	2771	2778	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020823	CAG	2	6	4195	4200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020823	ATT	2	6	4279	4284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020823	AGCC	2	8	4699	4706	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020823	A	6	6	5311	5316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020823	AAG	2	6	6008	6013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020823	TA	3	6	6024	6029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020823	ATAA	2	8	6033	6040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020823	TTG	2	6	6120	6125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020823	CT	3	6	8279	8284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020823	GTTA	2	8	8447	8454	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020823	TTA	2	6	9250	9255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020823	GTC	2	6	9256	9261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020823	CTT	2	6	9303	9308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020823	TAA	2	6	10448	10453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020823	TTTC	2	8	11172	11179	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020823	TTG	2	6	11196	11201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020823	TGAAAT	2	12	11223	11234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020823	ATT	2	6	11240	11245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020823	TAA	2	6	11249	11254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020823	TA	3	6	11308	11313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020823	TA	3	6	11423	11428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020823	T	6	6	11450	11455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020823	ATTTA	2	10	11463	11472	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020823	TAAA	2	8	11565	11572	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020823	ATTT	2	8	11585	11592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020823	TAA	2	6	11709	11714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020823	ATA	2	6	12208	12213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020823	A	6	6	12216	12221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020823	TGC	2	6	12257	12262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020823	TTAA	2	8	12266	12273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020823	CAA	2	6	12286	12291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020823	TTTG	2	8	12306	12313	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020823	AAATA	2	10	12337	12346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020823	AGTG	2	8	12347	12354	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020823	GGC	2	6	15789	15794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020823	GTT	2	6	15832	15837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020823	TTA	2	6	16927	16932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020823	GATT	2	8	17284	17291	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020823	T	6	6	17378	17383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020823	A	6	6	17425	17430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020823	TAT	2	6	17437	17442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020823	T	6	6	17457	17462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020823	ATT	2	6	17534	17539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020823	CAT	2	6	17577	17582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020823	ATC	2	6	17644	17649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020823	T	6	6	17759	17764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020823	TGCT	2	8	17787	17794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020823	TGA	2	6	17805	17810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020823	CTT	2	6	17826	17831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020823	ATTATC	2	12	17850	17861	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_020823	TCC	2	6	17874	17879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.